Головним мінусом встановлення газобалонного обладнання є його висока вартість. Попри те що газ майже вдвічі дешевший за бензин, для окупності системи потрібно проїхати приблизно 30 тисяч кілометрів на газі, що для одних водіїв займає кілька місяців, а для інших – кілька років.
Він також звертає увагу на те, що громіздкий балон займає частину багажника або зменшує кліренс у разі встановлення під кузовом, а додаткова вага обладнання підвищує навантаження на автомобіль і може впливати на керованість.
Окремою проблемою є обслуговування та ремонт ГБО, які слід виконувати лише у спеціалізованих сервісах, що трапляються значно рідше за звичайні СТО, тому це може створювати труднощі під час далеких поїздок або несподіваних поломок.
Крім того, експерт підсумовує, що навіть сучасні системи ГБО не дають двигуну повністю реалізувати свій потенціал, адже можливе незначне зниження потужності на високих обертах і потенційний вплив на ресурс моторів із високим рівнем форсування.