Створена нова техніка, що покращує виявлення ракової ДНК в крові

Команда під керівництвом дослідників з Массачусетського технологічного інституту та Гарварду розробила новий метод для точного й ефективного визначення тисяч мутацій ДНК у зразку крові пацієнта з мінімальною секвенцією. Підхід, названий MAESTRO, може одного дня дозволити виявляти рак у пацієнтів, які пройшли лікування, попереджаючи лікарів про рецидив захворювання раніше і дешевше, ніж дозволяють сучасні методи.

«Здатність знаходити рідкісні мутації в клінічному зразку корисна в багатьох областях біомедицини та діагностики», – пояснив співавтор Віктор Адальштейнсон, заступник директора Центру діагностики раку Герстнера в Інституті Броуда. «Сучасні методи вимагають великого секвенування, щоб знайти фрагменти ДНК з низьким вмістом, тоді як MAESTRO достатньо чутливий, щоб знайти тисячі мутацій із у сто разів меншим секвенуванням».

Читайте також: Генна терапія допоможе “відключати” гени алергії

У пацієнта з раком пухлинні клітини викидають фрагменти своєї ДНК в кров — фрагменти з контрольними мутаціями, які вказують на те, що вони походять із хворої тканини. Але будь-яка пухлинна ДНК у зразку крові є крихітною фракцією,

що плаває в морі здорового генетичного матеріалу. Точне виявлення цієї невеликої кількості ДНК є проблемою, особливо під час пошуку невеликої кількості пухлинних клітин, що залишилися після лікування раку (так звана «мінімальна залишкова хвороба» або MRD).

Раніше команда продемонструвала успіх у виявленні невеликої кількості залишкової ракової ДНК із зразків крові шляхом сканування сотень мутацій раку. Сканування тисяч мутацій може ще більше підвищити швидкість виявлення MRD, але для отримання точних результатів зазвичай потрібна величезна кількість секвенування. MAESTRO, що означає «секвенування, збагачене незначними алелями, шляхом розпізнавання олігонуклеотидів», є більш ефективним підходом для виявлення низькочастотних мутацій.

Джерело: https://medicalxpress.com/news/2022-03-technique-cancer-dna-blood.html